Las Floraciones Algales Nocivas (FAN), comúnmente conocidas como Marea Roja, afectan la salud humana y ambiental, así como actividades económicas como la pesca, acuicultura y turismo. Con el fin predecir y minimizar el impacto de las FAN, agencias pertenecientes a la UNESCO han planteado programas de investigación interdisciplinarios, en los que se contempla la definición de las características biológicas y de adaptación que determinan cómo, cuándo y bajo qué condiciones las microalgas nocivas se presentan y producen sus efectos dañinos. Sin embargo, para lograr este objetivo es necesario que primero se aislen y mantengan cepas en cultivo y se formalice el establecimiento de colecciones de referencia.

Con el propósito de apoyar las metas de las agencias internacionales de investigación relacionadas con el estudio de las FAN, sometimos ante el CONACyT (Convocatoria 2000) el proyecto titulado: "Hacia el establecimiento del primer banco de información taxonómica y biológica de dinoflagelados en México", cuyo objetivo principal es el establecimiento de la primera colección viva de dinoflagelados marinos en México. Los resultados de esta convocatoria fueron favorables, por lo que a partir de octubre del 2000 iniciamos los trabajos tendientes a establecer la Colección de Dinoflagelados Marinos (CODIMAR), que culminaron con su inauguración en febrero de 2004 a través de este espacio en Internet.

En febrero de 2004 la CODIMAR fue formalmente registrada en el Padrón de Colecciones Científicas y Museográficas Públicas o Privadas de Especímenes Silvestres (clave BCS-ALG-161-0104) y en el Padrón de Prestadores de Servicios vinculados con la comercialización de ejemplares, partes y derivados de la vida silvestre (clave SGPA-DGVS-COM-081-D.F.) de la Secretaría de Medio Ambiente y Recursos Naturales.

El 16 de mayo de 2007 el Director General del CIBNOR, Dr. Sergio Hernández Vázquez, otorga el nombramiento de Curadora de la CODIMAR a la Dra. Lourdes Morquecho Escamilla.

Actualmente el acervo de la colección está conformado con las principales especies nocivas de México. Asimismo, como resultado de la asistencia técnica que se le dio a una egresada del posgrado del CIBNOR, se cuenta con varias cepas aisladas de un área del litoral noroccidental de Cuba.

La función primordial de la colección es la de proveer cultivos de dinoflagelados a la comunidad científica y académica nacional e internacional, para que sean utilizados en investigación y enseñanza.